بخش تحقیقات دانه های روغنی از سال 1348 با هدف پشتیبانی علمی و فنی برای توسعه کشت و تولید دانه های روغنی در ایران تشکیل شده است. برنامه های تحقیقاتی آفتابگردان و سویا از سال 1348، گلرنگ و کنجد از سال 1349 و کلزا از سال 1368 آغاز شده است. فعالیتهای تحقیقات دانه های روغنی و تولید بذر در 30 ایستگاه تحقیقاتی در 21 مرکز تحقیقات استانی انجام می شود. تاکنون تعداد 69  رقم سازگار و پرمحصول از پنج گیاه روغنی شامل 20 رقم سویا، 17 رقم کلزا، 14 رقم هیبرید آفتابگردان، 10 رقم کنجد و 8 رقم گلرنگ توسط محققان این موسسه در کرج و مراکز تحقیقات استانی اصلاح و معرفی شده است. امتیاز تولید بذر گواهی شده 24 رقم از 69 رقم معرفی شده شامل ده رقم کلزا، ده رقم سویا، سه رقم آفتابگردان و یک رقم گلرنگ در قالب 28 قرارداد جداگانه به بخش خصوصی واگذار شده است.